AI och biologi på UC Berkeley

Under min femte termin vid UC Berkeley, där jag läser datavetenskap och bioteknik, fungerade stipendiet från Anna Whitlocks Minnesfond som ett betydelsefullt erkännande. Bidraget gav mig en välbehövlig extra stabilitet i vardagen som gjorde att jag kunde lägga fullt fokus på mina studier och åtaganden.

Då min utbildning är starkt forskningsinriktad ägnade jag en stor del av terminen åt att applicera AI på biologiska system. I professor Yun S. Songs labb är jag en del av det team som finansieras av Google.org [1] i ett nytt initiativ kring ”Genomic Language Models” och ”Foundation Models” för mikrobiom. Enkelt förklarat anpassar vi teknik liknande den bakom ChatGPT, fast tränad på DNA-sekvenser, för att förstå och designa mikrobiella samhällen. Parallellt med detta använde jag maskininlärning för att vidareutveckla mjukvara för beräkningsimmunologi i ett samarbete med Dr. Nick Borcherding. Det var detta specifika projekt som heter ”Ibex” jag presenterade vid en poster-session på campus, vilket är vad bilden ovan föreställer.

Utanför labbet är jag verksamhets- och teknikansvarig i den grundande styrelsen för studentföreningen ”Computational Biology at Berkeley” [2]. Det har varit otroligt givande att få ge tillbaka till student-communityt genom att bygga vår webbplattform och arrangera event som gratis workshops och tävlingen ”Biotech Pitchathon”.

Dessa insatser resulterade i mina hittills bästa studieresultat och en plats på ”Dean’s List”. Jag är oerhört tacksam för stödet från Anna Whitlocks Minnesfond, som gav mig förutsättningarna att kunna prestera på den här nivån.

[1] Läs mer om forskningsanslaget här: https://innovativegenomics.org/news/igi-funding-google-org-for-ai-science-research/
[2] Läs mer om föreningen här: https://compbioatberkeley.github.io